Данное растение является злостным карантинным сорняком. Вред амброзии в районах массового ее распространения исключительно велик. Она причиняет ущерб окружающей среде, земледелию. Развивая мощную надземную массу и корневую систему, сильно угнетает культурные растения, что приводит к резкому снижению, а то и полной потери урожая. На засоренных амброзией полях резко падает производительность сельскохозяйственной техники, ухудшается качество полевых работ и затрудняется уборка урожая.
Амброзия полыннолистная опасна и для здоровья людей. Во время цветения она образует огромное количество пыльцы, которая вызывает заболевание амброзийный поллиноз.
К борьбе с данным карантинным объектом следует подходить системно с использованием агротехнический и химических мер борьбы. Скашивание сорняка приносит результат только при его постоянном проведении. Самое главное, мероприятия по ее истреблению должны проводиться до наступления фазы обсеменения. Это предотвратит угрозу массового распространения карантинного сорняка.
Всем хранителям зерна необходимо тщательно провести очистку складских помещений перед приемкой новых партий зерна, предназначенных к последующей отгрузке на экспорт, а также их проверку с учетом фитосанитарных требований.